Report for progress on study modeling and analysis for the comparison of the presence of post-acute RSV infection in COVID-positive patients compared to comparison groups (influenza and other acute respiratory infections).
This attrition table considers the cohort entry period to be defined from March 1, 2022 to July 1, 2022. This means that the study outcome window will extend from April 1, 2022 to January 1, 2023.
Attrition based on cohort inclusion criteria. Inclusion criteria were computed according to the following rules.
Patients under 6 years old with at least one visit during cohort entry period (Jan 1 - July 1, 2022, may be tightened as desired)
Had evidence of either SARS-CoV-2 infection, Influenza, or any other respiratory infection within the cohort entry period
Had at least 1 visit within 18 months of index date, and at least 1 visit in the 1-6 months following the index date (follow up period)
Index sub-cohort group was selected according to the following logic:
Select as initial index type and date the earliest evidence of SARS-CoV-2 or Influenza or other ARI
If a patient’s index category is an other ARI but they have evidence of SARS-CoV-2 or Influenza within 7 days, update the index category to SARS-CoV-2/Influenza accordingly, but keep the index date the same as the preliminary ARI diagnosis
Exclusions:
No prior SARS-CoV-2 ever, via test, diagnosis, or serology positive
No Influenza within pre-acute or acute period (6 months before index)
No prior RSV (outcome) or RSV within acute period
No co-infection of Influenza and SARS-Cov-2 within acute period
| Attrition step | persons |
|---|---|
| Patients under 6 years old with at least 1 visit during CE period | 1,193,020 |
| Had at least 1 of COVID, influenza, and/or other respiratory infection event during CE period | 166,509 |
| Had COVID during CE period | 34,623 |
| Had influenza during CE period | 18,394 |
| Had other respiratory infection during CE period | 124,999 |
| Meets utilization inclusion criteria | 105,787 |
| Not excluded due to overlapping index infections | 90,045 |
| Final COVID sub-cohort | 21,718 |
| Final Influenza sub-cohort | 8,351 |
| Final Other respiratory sub-cohort | 59,967 |
This attrition table considers the cohort entry period to be defined from June 1, 2021 to March 1, 2023. This means that the study outcome window will extend from July 1, 2021 to March 1, 2023.
Attrition based on cohort inclusion criteria. Inclusion criteria were computed according to the following rules.
Patients under 6 years old with at least one visit during cohort entry period (June 1, 2021 to February 01, 2023 may be tightened as desired)
Had evidence of either SARS-CoV-2 infection or Influenza infection within the cohort entry period
Had at least 1 visit within 18 months of index date, and at least 1 visit in the 1-6 months following the index date (follow up period)
Exclusions:
No prior SARS-CoV-2 ever, via test, diagnosis, or serology positive
No Influenza within pre-acute or acute period (6 months before index)
No prior RSV (outcome) or RSV within acute period
No co-infection of Influenza and SARS-Cov-2 within acute period
| Attrition step | persons |
|---|---|
| Patients under 6 years old with at least 1 visit during CE period | 2,008,744 |
| Had at least 1 of COVID, influenza infection event during CE period | 288,139 |
| Had COVID during CE period | 222,854 |
| Had influenza during CE period | 79,768 |
| Meets utilization inclusion criteria | 188,466 |
| Not excluded due to overlapping index infections | 184,848 |
| Final COVID sub-cohort | 145,424 |
| Final Influenza sub-cohort | 39,424 |
| COVID (N=21537) |
Influenza (N=8317) |
Respiratory (N=59798) |
Overall (N=89652) |
|
|---|---|---|---|---|
PI: Pacific Islander *Low, moderate, and high utilizers correspond to the 33th, 66th, and 97.5th percentile of the number of visits in the cohort | ||||
| age_cat_at_ce | ||||
| <6 months | 3029 (14.1%) | 402 (4.8%) | 11013 (18.4%) | 14444 (16.1%) |
| 6m-1y old | 4219 (19.6%) | 752 (9.0%) | 10064 (16.8%) | 15035 (16.8%) |
| 1-2y old | 5162 (24.0%) | 1561 (18.8%) | 11496 (19.2%) | 18219 (20.3%) |
| 2-3y old | 3574 (16.6%) | 1669 (20.1%) | 9728 (16.3%) | 14971 (16.7%) |
| 3-4y old | 2784 (12.9%) | 1908 (22.9%) | 9011 (15.1%) | 13703 (15.3%) |
| 4-5y old | 2769 (12.9%) | 2025 (24.3%) | 8486 (14.2%) | 13280 (14.8%) |
| Age categories | ||||
| Female | 10000 (46.4%) | 3830 (46.1%) | 27486 (46.0%) | 41316 (46.1%) |
| Male | 11537 (53.6%) | 4487 (53.9%) | 32312 (54.0%) | 48336 (53.9%) |
| Race/ethnicity | ||||
| Hispanic | 4017 (18.7%) | 3349 (40.3%) | 15518 (26.0%) | 22884 (25.5%) |
| Non-Hispanic Asian/PI | 1705 (7.9%) | 290 (3.5%) | 2855 (4.8%) | 4850 (5.4%) |
| Non-Hispanic Black | 2777 (12.9%) | 1633 (19.6%) | 9773 (16.3%) | 14183 (15.8%) |
| Non-Hispanic Multiple | 539 (2.5%) | 153 (1.8%) | 1509 (2.5%) | 2201 (2.5%) |
| Non-Hispanic White | 9557 (44.4%) | 2321 (27.9%) | 23275 (38.9%) | 35153 (39.2%) |
| Other/Unknown | 2942 (13.7%) | 571 (6.9%) | 6868 (11.5%) | 10381 (11.6%) |
| Insurance class | ||||
| Public | 1258 (5.8%) | 893 (10.7%) | 5407 (9.0%) | 7558 (8.4%) |
| Private | 2793 (13.0%) | 775 (9.3%) | 7091 (11.9%) | 10659 (11.9%) |
| Other | 5396 (25.1%) | 3499 (42.1%) | 19527 (32.7%) | 28422 (31.7%) |
| Missing | 12090 (56.1%) | 3150 (37.9%) | 27773 (46.4%) | 43013 (48.0%) |
| Prior inpatient visit frequency* | ||||
| High Utilizer | 362 (1.7%) | 58 (0.7%) | 386 (0.6%) | 806 (0.9%) |
| Low Utilizer | 3527 (16.4%) | 765 (9.2%) | 8256 (13.8%) | 12548 (14.0%) |
| No Visits | 17648 (81.9%) | 7494 (90.1%) | 51156 (85.5%) | 76298 (85.1%) |
| Prior outpatient visit frequency* | ||||
| High Utilizer | 9945 (46.2%) | 2534 (30.5%) | 16799 (28.1%) | 29278 (32.7%) |
| Moderate Utilizer | 5148 (23.9%) | 2255 (27.1%) | 15876 (26.5%) | 23279 (26.0%) |
| Low Utilizer | 3835 (17.8%) | 1997 (24.0%) | 15587 (26.1%) | 21419 (23.9%) |
| No Visits | 2609 (12.1%) | 1531 (18.4%) | 11536 (19.3%) | 15676 (17.5%) |
| Prior ED visit frequency* | ||||
| High Utilizer | 661 (3.1%) | 422 (5.1%) | 550 (0.9%) | 1633 (1.8%) |
| Moderate Utilizer | 1966 (9.1%) | 1090 (13.1%) | 3369 (5.6%) | 6425 (7.2%) |
| Low Utilizer | 3285 (15.3%) | 1501 (18.0%) | 8529 (14.3%) | 13315 (14.9%) |
| No Visits | 15625 (72.5%) | 5304 (63.8%) | 47350 (79.2%) | 68279 (76.2%) |
| visit_type_inpatient | ||||
| no_visits | 17648 (81.9%) | 7494 (90.1%) | 51156 (85.5%) | 76298 (85.1%) |
| visits_3_or_more | 362 (1.7%) | 58 (0.7%) | 386 (0.6%) | 806 (0.9%) |
| visits_less_than_3 | 3527 (16.4%) | 765 (9.2%) | 8256 (13.8%) | 12548 (14.0%) |
| Test confirm diagnosis | ||||
| Diagnosis only | 9541 (44.3%) | 7913 (95.1%) | 59798 (100%) | 77252 (86.2%) |
| Lab confirmed | 11996 (55.7%) | 404 (4.9%) | 0 (0%) | 12400 (13.8%) |
| Hospitalized at index visit | ||||
| Hospitalized | 1951 (9.1%) | 646 (7.8%) | 4714 (7.9%) | 7311 (8.2%) |
| Not hospitalized | 19586 (90.9%) | 7671 (92.2%) | 55084 (92.1%) | 82341 (91.8%) |
| COVID (N=126655) |
Influenza (N=14820) |
Overall (N=141475) |
|
|---|---|---|---|
PI: Pacific Islander *Low, moderate, and high utilizers correspond to the 33th, 66th, and 97.5th percentile of the number of visits in the cohort | |||
| age_cat_at_ce | |||
| <6 months | 20203 (16.0%) | 882 (6.0%) | 21085 (14.9%) |
| 6m-1y old | 24398 (19.3%) | 1536 (10.4%) | 25934 (18.3%) |
| 1-2y old | 28866 (22.8%) | 2954 (19.9%) | 31820 (22.5%) |
| 2-3y old | 20666 (16.3%) | 3014 (20.3%) | 23680 (16.7%) |
| 3-4y old | 17312 (13.7%) | 3205 (21.6%) | 20517 (14.5%) |
| 4-5y old | 15210 (12.0%) | 3229 (21.8%) | 18439 (13.0%) |
| Age categories | |||
| Female | 58283 (46.0%) | 6806 (45.9%) | 65089 (46.0%) |
| Male | 68372 (54.0%) | 8014 (54.1%) | 76386 (54.0%) |
| Race/ethnicity | |||
| Hispanic | 29026 (22.9%) | 5700 (38.5%) | 34726 (24.5%) |
| Non-Hispanic Asian/PI | 6693 (5.3%) | 563 (3.8%) | 7256 (5.1%) |
| Non-Hispanic Black | 21697 (17.1%) | 2856 (19.3%) | 24553 (17.4%) |
| Non-Hispanic Multiple | 3073 (2.4%) | 298 (2.0%) | 3371 (2.4%) |
| Non-Hispanic White | 51448 (40.6%) | 4390 (29.6%) | 55838 (39.5%) |
| Other/Unknown | 14718 (11.6%) | 1013 (6.8%) | 15731 (11.1%) |
| Insurance class | |||
| Public | 8461 (6.7%) | 1354 (9.1%) | 9815 (6.9%) |
| Private | 12125 (9.6%) | 1192 (8.0%) | 13317 (9.4%) |
| Other | 33981 (26.8%) | 6526 (44.0%) | 40507 (28.6%) |
| Missing | 72088 (56.9%) | 5748 (38.8%) | 77836 (55.0%) |
| Prior inpatient visit frequency* | |||
| High Utilizer | 1242 (1.0%) | 73 (0.5%) | 1315 (0.9%) |
| Moderate Utilizer | 0 (0%) | 0 (0%) | 0 (0%) |
| Low Utilizer | 20809 (16.4%) | 1580 (10.7%) | 22389 (15.8%) |
| No Visits | 104604 (82.6%) | 13167 (88.8%) | 117771 (83.2%) |
| Prior outpatient visit frequency* | |||
| High Utilizer | 45100 (35.6%) | 3866 (26.1%) | 48966 (34.6%) |
| Moderate Utilizer | 39892 (31.5%) | 4729 (31.9%) | 44621 (31.5%) |
| Low Utilizer | 24299 (19.2%) | 3575 (24.1%) | 27874 (19.7%) |
| No Visits | 17364 (13.7%) | 2650 (17.9%) | 20014 (14.1%) |
| Prior ED visit frequency* | |||
| High Utilizer | 2621 (2.1%) | 433 (2.9%) | 3054 (2.2%) |
| Moderate Utilizer | 14768 (11.7%) | 2305 (15.6%) | 17073 (12.1%) |
| Low Utilizer | 20780 (16.4%) | 2636 (17.8%) | 23416 (16.6%) |
| No Visits | 88486 (69.9%) | 9446 (63.7%) | 97932 (69.2%) |
| Test confirm diagnosis | |||
| Diagnosis only | 42752 (33.8%) | 14242 (96.1%) | 56994 (40.3%) |
| Lab confirmed | 83903 (66.2%) | 578 (3.9%) | 84481 (59.7%) |
| Hospitalized at index visit | |||
| No | 114313 (90.3%) | 13647 (92.1%) | 127960 (90.4%) |
| Yes | 12342 (9.7%) | 1173 (7.9%) | 13515 (9.6%) |
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
| RSV 0-60d: Unweighted, unadjusted | RSV 0-60d: Weighted, adjusted | RSV 1-60d: Unweighted, unadjusted | RSV 1-60d: Weighted, adjusted | RSV 15-180d: Unweighted, unadjusted | RSV 15-180d: Weighted, adjusted | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| (Intercept) | 0.02 *** | 0.07 *** | 0.00 *** | 0.04 *** | 0.02 *** | 0.11 *** |
| (0.08)Â Â Â | (0.30)Â Â Â | (0.17)Â Â Â | (0.58)Â Â Â | (0.08)Â Â Â | (0.30)Â Â Â | |
| `SARS-CoV-2 Infection: ` | 1.60 *** | 1.30 *** | 1.27Â Â Â Â | 0.82Â Â Â Â | 1.18Â Â Â Â | 0.78 **Â |
| (0.09)Â Â Â | (0.08)Â Â Â | (0.20)Â Â Â | (0.18)Â Â Â | (0.10)Â Â Â | (0.08)Â Â Â | |
| `Age groups: `1-2y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.38 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.19 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.37 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.29)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | |
| `Age groups: `2-3y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.45 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.17 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.30 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.14)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.32)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.14)Â Â Â | |
| `Age groups: `3-4y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.41 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.12 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.19 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.15)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.38)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.17)Â Â Â | |
| `Age groups: `4-5y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.41 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.10 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.10 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.15)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.44)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.22)Â Â Â | |
| `Age groups: `6m-1y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.23)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.12)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Asian/PI | Â Â Â Â Â Â Â | 0.45 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.05 *Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.91Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.26)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (1.43)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.20)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Black/AA | Â Â Â Â Â Â Â | 2.02 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.08Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.33 *Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.11)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.23)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.12)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Multiple | Â Â Â Â Â Â Â | 1.72 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.34Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.55Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.20)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.40)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.31)Â Â Â | |
| `Race: `NH_White | Â Â Â Â Â Â Â | 0.97Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.47 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.86Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.11)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.23)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.11)Â Â Â | |
| `Race: `Other/Unknown | Â Â Â Â Â Â Â | 0.30 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.22 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.69 *Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.24)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.49)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.17)Â Â Â | |
| `Gender: `Male | Â Â Â Â Â Â Â | 1.11Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.33Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.08Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.08)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.18)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.08)Â Â Â | |
| `Hospitalized for index infection: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 2.03 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 4.41 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 4.18 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.10)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.19)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.09)Â Â Â | |
| util_inpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.43 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.33 *Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.05Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.22)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.45)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.26)Â Â Â | |
| util_inpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.56 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.55Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.90Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.20)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.42)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.26)Â Â Â | |
| util_outpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.99Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.91Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.19Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.27)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | |
| util_outpatientModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.73 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.86Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.11)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.26)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.12)Â Â Â | |
| util_outpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.87Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.79Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.33 *Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.14)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.30)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | |
| util_edLow | Â Â Â Â Â Â Â | 2.30 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.12Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.84Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.22)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.43)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.17)Â Â Â | |
| util_edModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 1.80 *Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.13Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.76Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.23)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.44)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.18)Â Â Â | |
| util_edNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.76 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.98Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.58 **Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.22)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.41)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.17)Â Â Â | |
| util_otherLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.28 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.51 *Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 **Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.14)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.33)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | |
| util_otherModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.54 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.88Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 **Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.10)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.26)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.12)Â Â Â | |
| util_otherNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.24 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.98Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.66 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.13)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.24)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.12)Â Â Â | |
| N | 27894Â Â Â Â Â Â Â | 27894Â Â Â Â Â Â Â | 27894Â Â Â Â Â Â Â | 27894Â Â Â Â Â Â Â | 27894Â Â Â Â Â Â Â | 27894Â Â Â Â Â Â Â |
| AIC | 6957.93Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1774.80Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 5726.15Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| BIC | 6974.41Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1791.27Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 5742.63Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| Pseudo R2 | 0.00Â Â Â Â | 0.11Â Â Â Â | 0.00Â Â Â Â | 0.10Â Â Â Â | 0.00Â Â Â Â | 0.09Â Â Â Â |
| *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05. | ||||||
| Unweighted, unadjusted | Unweighted, adjusted | Weighted (LR), unadjusted | Weighted (LR), adjusted | |
|---|---|---|---|---|
| (Intercept) | 0.76 *** | 2.21 *** | 0.84 *** | 2.46 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.07)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| `SARS-CoV-2 Infection: ` | 0.63 *** | 0.63 *** | 0.56 *** | 0.57 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `1-2y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.65 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `2-3y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.66 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.64 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `3-4y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.66 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.64 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `4-5y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.61 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `6m-1y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Asian/PI | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Black/AA | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Multiple | Â Â Â Â Â Â Â | 0.76 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.79 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| `Race: `NH_White | Â Â Â Â Â Â Â | 0.87 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.88 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `Other/Unknown | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.69 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Gender: `Male | Â Â Â Â Â Â Â | 1.02Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.02Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Hospitalized for index infection: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.55 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.54 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_inpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 1.18 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.12Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | |
| util_inpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.21 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.15 *Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | |
| util_outpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.73 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.65 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_edLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.62 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.65 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.73 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.48 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.50 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_otherLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.95 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.96 *Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.88 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.89 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.27 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.26 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Pulmonary Respiratory: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.32 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.33 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| N | 130486Â Â Â Â Â Â Â | 130486Â Â Â Â Â Â Â | 130486Â Â Â Â Â Â Â | 130486Â Â Â Â Â Â Â |
| AIC | 165648.52Â Â Â Â | 161135.61Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| BIC | 165668.07Â Â Â Â | 161389.87Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| Pseudo R2 | 0.01Â Â Â Â | 0.05Â Â Â Â | 0.01Â Â Â Â | 0.05Â Â Â Â |
| *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05. | ||||
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
| Unweighted, unadjusted | Unweighted, adjusted | Weighted (LR), unadjusted | Weighted (LR), adjusted | |
|---|---|---|---|---|
| (Intercept) | 0.89 *** | 3.94 *** | 0.96 *** | 6.02 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.07)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.08)Â Â Â | |
| `SARS-CoV-2 Infection: ` | 0.71 *** | 0.71 *** | 0.66 *** | 0.66 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Age groups: `1-2y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `2-3y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `3-4y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.66 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.54 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `4-5y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.62 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.51 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `6m-1y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.82 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.79 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Asian/PI | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Black/AA | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.72 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Multiple | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.86 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| `Race: `NH_White | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.80 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `Other/Unknown | Â Â Â Â Â Â Â | 0.64 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.74 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Gender: `Male | Â Â Â Â Â Â Â | 0.99Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.98Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Hospitalized for index infection: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.57 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.61 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_inpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.92Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_inpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.94Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_outpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.62 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.65 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_edLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.71 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.43 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.45 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_otherLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.91 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.03Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.85 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.93 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.19 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.33 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Pulmonary Respiratory: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.22 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.16 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| N | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â |
| AIC | 174954.16Â Â Â Â | 169485.99Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| BIC | 174973.72Â Â Â Â | 169740.26Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| Pseudo R2 | 0.00Â Â Â Â | 0.06Â Â Â Â | 0.00Â Â Â Â | 0.06Â Â Â Â |
| *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05. | ||||
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
| Unweighted, unadjusted | Unweighted, adjusted | Weighted (LR), unadjusted | Weighted (LR), adjusted | |
|---|---|---|---|---|
| (Intercept) | 0.68 *** | 1.97 *** | 0.75 *** | 3.06 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.07)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| `SARS-CoV-2 Infection: ` | 0.70 *** | 0.71 *** | 0.64 *** | 0.64 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Age groups: `1-2y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.60 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `2-3y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.66 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.65 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `3-4y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.57 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `4-5y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.61 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.55 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `6m-1y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Asian/PI | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.72 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Black/AA | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.72 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Multiple | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.86 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| `Race: `NH_White | Â Â Â Â Â Â Â | 0.87 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.87 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `Other/Unknown | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.76 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Gender: `Male | Â Â Â Â Â Â Â | 1.02Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.00Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Hospitalized for index infection: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.57 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.62 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_inpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 1.17 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.73 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_inpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.20 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_outpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.74 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.60 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_edLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.73 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.79 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.48 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.56 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_otherLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.95 **Â | Â Â Â Â Â Â Â | 1.08 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.88 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.93 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.28 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.36 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Pulmonary Respiratory: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.32 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.25 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| N | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â |
| AIC | 165668.97Â Â Â Â | 161097.68Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| BIC | 165688.53Â Â Â Â | 161351.95Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| Pseudo R2 | 0.00Â Â Â Â | 0.05Â Â Â Â | 0.00Â Â Â Â | 0.05Â Â Â Â |
| *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05. | ||||
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
| Unweighted, unadjusted | Unweighted, adjusted | Weighted (LR), unadjusted | Weighted (LR), adjusted | |
|---|---|---|---|---|
| (Intercept) | 0.89 *** | 3.94 *** | 0.96 *** | 6.02 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.07)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.08)Â Â Â | |
| `SARS-CoV-2 Infection: ` | 0.71 *** | 0.71 *** | 0.66 *** | 0.66 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Age groups: `1-2y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `2-3y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `3-4y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.66 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.54 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `4-5y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.62 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.51 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `6m-1y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.82 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.79 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Asian/PI | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Black/AA | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.72 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Multiple | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.86 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| `Race: `NH_White | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.80 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `Other/Unknown | Â Â Â Â Â Â Â | 0.64 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.74 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Gender: `Male | Â Â Â Â Â Â Â | 0.99Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.98Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Hospitalized for index infection: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.57 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.61 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_inpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.92Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_inpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.94Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_outpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.62 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.65 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_edLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.71 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.43 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.45 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_otherLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.91 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.03Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.85 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.93 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.19 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.33 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Pulmonary Respiratory: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.22 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.16 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| N | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â |
| AIC | 174954.16Â Â Â Â | 169485.99Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| BIC | 174973.72Â Â Â Â | 169740.26Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| Pseudo R2 | 0.00Â Â Â Â | 0.06Â Â Â Â | 0.00Â Â Â Â | 0.06Â Â Â Â |
| *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05. | ||||
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
| Unweighted, unadjusted | Unweighted, adjusted | Weighted (LR), unadjusted | Weighted (LR), adjusted | |
|---|---|---|---|---|
| (Intercept) | 0.89 *** | 3.94 *** | 0.96 *** | 6.02 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.07)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.08)Â Â Â | |
| `SARS-CoV-2 Infection: ` | 0.71 *** | 0.71 *** | 0.66 *** | 0.66 *** |
| (0.02)Â Â Â | (0.02)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Age groups: `1-2y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `2-3y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `3-4y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.66 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.54 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `4-5y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.62 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.51 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Age groups: `6m-1y old | Â Â Â Â Â Â Â | 0.82 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.79 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Asian/PI | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.03)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Black/AA | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.72 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `NH_Multiple | Â Â Â Â Â Â Â | 0.77 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.86 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| `Race: `NH_White | Â Â Â Â Â Â Â | 0.78 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.80 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Race: `Other/Unknown | Â Â Â Â Â Â Â | 0.64 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.74 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Gender: `Male | Â Â Â Â Â Â Â | 0.99Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.98Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.01)Â Â Â | |
| `Hospitalized for index infection: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.57 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.61 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_inpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.92Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.63 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_inpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.94Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | 0.68 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.06)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.07)Â Â Â | |
| util_outpatientLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.67 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.62 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.75 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_outpatientNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.65 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_edLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.59 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.71 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.70 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_edNone | Â Â Â Â Â Â Â | 0.43 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.45 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.04)Â Â Â | |
| util_otherLow | Â Â Â Â Â Â Â | 0.91 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.03Â Â Â Â |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherModerate | Â Â Â Â Â Â Â | 0.85 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 0.93 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| util_otherNone | Â Â Â Â Â Â Â | 1.19 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.33 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| `Pulmonary Respiratory: `Yes | Â Â Â Â Â Â Â | 1.22 *** | Â Â Â Â Â Â Â | 1.16 *** |
| Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | (0.02)Â Â Â | |
| N | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â | 130564Â Â Â Â Â Â Â |
| AIC | 174954.16Â Â Â Â | 169485.99Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| BIC | 174973.72Â Â Â Â | 169740.26Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â | Â Â Â Â Â Â Â |
| Pseudo R2 | 0.00Â Â Â Â | 0.06Â Â Â Â | 0.00Â Â Â Â | 0.06Â Â Â Â |
| *** p < 0.001; ** p < 0.01; * p < 0.05. | ||||
| sub_cohort | outcome_rsv_same_day | outcome_rsv_1_to_60 | outcome_rsv_61_to_180 | n | total | p | pct |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| COVID | 0 | 0 | 1 | 463 | 21,537 | 0.02 | 2.15 % |
| COVID | 0 | 1 | 0 | 113 | 21,537 | 0.01 | 0.52 % |
| COVID | 1 | 0 | 0 | 545 | 21,537 | 0.03 | 2.53 % |
| Influenza | 0 | 0 | 1 | 131 | 8,317 | 0.02 | 1.58 % |
| Influenza | 0 | 1 | 0 | 34 | 8,317 | 0.00 | 0.41 % |
| Influenza | 1 | 0 | 0 | 126 | 8,317 | 0.02 | 1.51 % |
| Respiratory | 0 | 0 | 1 | 1,313 | 59,798 | 0.02 | 2.2 % |
| Respiratory | 0 | 1 | 0 | 368 | 59,798 | 0.01 | 0.62 % |
| Respiratory | 1 | 0 | 0 | 388 | 59,798 | 0.01 | 0.65 % |
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"
## [1] "using LR weights"